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Text File  |  1995-03-04  |  1.6 KB  |  40 lines
  1. ************************
  2. * HIT family signature *
  3. ************************
  4.  
  5. Recently a family  of small proteins  of about 12 to 16 Kd  has been described
  6. [1]. This family currently consists of:
  7.  
  8.  - Bovine protein kinase C inhibitor 1 (PKCI-1). PKCI-1 seems to be, in vitro,
  9.    a specific inhibitor of PKC. It has been shown to bind zinc.
  10.  - Yeast protein HIT1.
  11.  - Escherichia coli hypothetical protein ycfF.
  12.  - A hypothetical 13.2 Kd protein in hisE 3'region in Azospirillum brasilense.
  13.  - A hypothetical 13.1 Kd protein in p37 5'region in Mycoplasma hyorhinis.
  14.  - A hypothetical 12.4 Kd protein in psbAII  5'region  in Synechococcus strain
  15.    PCC 7942.
  16.  
  17. The zinc-binding  site  of PKCI-1 [2]  consists  of  three histidines that are
  18. closely positioned. These histidines are  perfectly  conserved  in all members
  19. of this family for which  the name HIT, for HIstidine Triad, has been proposed
  20. [1]. Except for PKCI-1, the function of these proteins is not yet known. Their
  21. widespread evolutionary conservation suggests that they are important for some
  22. cellular process(es).
  23.  
  24. As a signature pattern, we selected the region of the histidine triad.
  25.  
  26. -Consensus pattern: N-x(4)-[GA]-x-Q-x-[LIVM]-x-H-x-H-[LIVMF]-H
  27.                     [The three H's are probaby zinc ligands]
  28. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL.
  29. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: NONE.
  30.  
  31. -Expert(s) to contact by email: Seraphin B.
  32.                                 seraphin@embl-heidelberg.de
  33.  
  34. -Last update: June 1994 / Text revised.
  35.  
  36. [ 1] Seraphin B.
  37.      DNA Seq. 3:177-179(1992).
  38. [ 2] Mozier N.M., Walsh M.P., Pearson J.D.
  39.      FEBS Lett. 279:14-18(1991).
  40.